「Automatically manage signing」が新しいアプリとして登録しようとしているようなので外して自分で Provisioning Profile を設定すれば先に進める。 全てが解決するわけじゃないので注意。

Failed Registering Bundle Identifier
The app identifier "<app identifier>" cannot be registered to your development team because it is not available. Change your bundle identifier to a unique string to try again.